Dalam melaksanakan tugasnya BKSDA Bali mempunyai Visi :
Terwujudnya pengelolaan sumber daya alam hayati dan pengelolaan hutan konservasi yang aman dan mantap secara legal formal, didukung kelembagaan yang kuat dalam pengelolaannya serta mampu memberikan manfaat optimal kepada masyarakat, untuk mendukung pembangunan Bali yang berkelanjutan.
Untuk mewujudkan Visi tersebut, BKSDA Bali mengemban Misi :
Memantapkan pengelolaan konservasi sumber daya alam hayati dan ekosistemnya.
Mengembangkan secara optimal pemanfaatan sumber daya alam hayati dan ekosistemnya berdasarkan prinsip kelestarian.
Memantapkan perlindungan hutan dan penegakan hukum (Law enforcement).
Mengembangkan kelembagaan dan kemitraan dalam rangka pengelolaan, perlindungan dan pemanfaatan sumber daya alam hayati dan ekosistemnya.